Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NKIRAS2Q9NYR9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NKIRAS2Q9NYR9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms