Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TOR4AQ9NXH8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms