Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASF1BQ9NVP2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms