Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms