Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL3Q9BXA9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL3Q9BXA9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms