Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TIMM29Q9BSF4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms