Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3CQ99985 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms