Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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GFI1Q99684 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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GFI1Q99684 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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GFI1Q99684 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GFI1Q99684 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GFI1Q99684 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GFI1Q99684 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFI1Q99684 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms