Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRRC1Q96M27 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms