Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF354BQ96LW1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF354BQ96LW1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms