Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
LINC00208Q96KT6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms