Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PGBD1Q96JS3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGBD1Q96JS3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms