Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GNPDA2Q8TDQ7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA2Q8TDQ7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms