Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC21AQ8NDW8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC21AQ8NDW8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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