Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF148Q8N7C7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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RNF148Q8N7C7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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RNF148Q8N7C7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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RNF148Q8N7C7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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RNF148Q8N7C7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RNF148Q8N7C7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RNF148Q8N7C7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RNF148Q8N7C7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RNF148Q8N7C7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RNF148Q8N7C7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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