Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
IGSF1Q8N6C5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGSF1Q8N6C5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms