Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FNDC7Q5VTL7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNDC7Q5VTL7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms