Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATAD3CQ5T2N8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATAD3CQ5T2N8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATAD3CQ5T2N8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATAD3CQ5T2N8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATAD3CQ5T2N8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATAD3CQ5T2N8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms