Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
KRTAP21-2Q3LI59 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
KRTAP21-2Q3LI59 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms