Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL40Q2TBA0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms