Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
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