Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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VAMP3Q15836 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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VAMP3Q15836 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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VAMP3Q15836 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VAMP3Q15836 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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