Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHRNA6Q15825 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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