Protein–RNA interactions for Protein: Q14746

COG2, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG2Q14746 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG2Q14746 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG2Q14746 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG2Q14746 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG2Q14746 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG2Q14746 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG2Q14746 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG2Q14746 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG2Q14746 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG2Q14746 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG2Q14746 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG2Q14746 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms