Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SMC1AQ14683 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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