Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF235Q14590 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF235Q14590 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms