Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CAPSQ13938 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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