Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP1Q13835 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP1Q13835 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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