Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM193AP78312 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms