Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GABRB3P28472 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms