Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH1P12830 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH1P12830 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH1P12830 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms