Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms