Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD9O00233 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMD9O00233 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms