Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01387J3KSC0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms