Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms