Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRID1Q9ULK0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRID1Q9ULK0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRID1Q9ULK0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRID1Q9ULK0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRID1Q9ULK0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms