Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CFDP1Q9UEE9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms