Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COPS7AQ9UBW8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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