Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C9orf78Q9NZ63 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms