Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKIRAS1Q9NYS0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms