Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.144e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MAPKAPK2-203ENST00000479009 749 ntTSL 322.14■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.124e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GLIS3-217ENST00000491889 797 ntTSL 1 (best)22.03■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DEF8-214ENST00000564379 2354 ntTSL 221.97■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HPGD-212ENST00000514584 827 ntTSL 221.95■■□□□ 1.12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.19e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EPS8L2-229ENST00000534755 474 ntTSL 421.91■■□□□ 1.12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF263-203ENST00000572748 759 ntTSL 221.91■■□□□ 1.19e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TNIP2-207ENST00000511352 572 ntTSL 321.89■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CCDC24-203ENST00000463846 1230 ntTSL 1 (best)21.85■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SULT1A1-205ENST00000562058 1876 ntTSL 1 (best)21.84■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SELENOS-205ENST00000528346 655 ntTSL 321.84■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ARRDC2-207ENST00000596105 566 ntTSL 221.83■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.079e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.072e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TRIO-223ENST00000515710 1913 ntTSL 321.67■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 STXBP2-218ENST00000599905 589 ntTSL 421.67■■□□□ 1.064e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.054e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GLIS3-216ENST00000490709 768 ntTSL 1 (best)21.63■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SULT1A1-207ENST00000564818 1653 ntTSL 1 (best)21.56■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 METTL9-210ENST00000570074 447 ntTSL 321.56■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC007388.1-203ENST00000422128 596 ntTSL 421.54■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 BICDL2-205ENST00000576826 1404 ntTSL 321.53■■□□□ 1.042e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CARS2-231ENST00000544488 575 ntTSL 421.48■■□□□ 1.032e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FCHO1-232ENST00000600209 881 ntTSL 521.43■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ERLIN2-208ENST00000521644 1602 ntTSL 521.33■■□□□ 12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 STX5-208ENST00000492066 1627 ntTSL 521.3■■□□□ 12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TPD52-215ENST00000520795 445 ntTSL 221.3■■□□□ 12e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 14e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.999e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.994e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DRC3-218ENST00000585108 490 ntTSL 421.12■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MUS81-213ENST00000530928 1793 ntTSL 221.08■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM199-205ENST00000555264 674 ntTSL 521.07■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SULT1A1-206ENST00000563493 1651 ntTSL 521.07■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 APOO-204ENST00000490078 916 ntTSL 1 (best)21.06■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 C1orf61-220ENST00000489918 427 ntTSL 321.01■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HMBS-215ENST00000542822 936 ntTSL 521.01■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RGS12-211ENST00000506998 1625 ntTSL 1 (best)20.98■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.949e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ANKRD6-215ENST00000520886 568 ntTSL 320.94■□□□□ 0.942e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.942e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.942e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 C1orf61-210ENST00000465270 543 ntTSL 220.83■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RGS3-223ENST00000488620 1725 ntTSL 1 (best)20.81■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HAPLN2-202ENST00000456112 882 ntTSL 520.73■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 COMMD1-208ENST00000472729 629 ntTSL 320.68■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 IRGQ-203ENST00000598324 564 ntTSL 220.68■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TPD52-226ENST00000523753 587 ntTSL 420.68■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 YY1-202ENST00000553625 422 ntTSL 220.66■□□□□ 0.99e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM11-205ENST00000584432 1648 ntTSL 220.65■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DPP9-223ENST00000601720 798 ntTSL 320.64■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 B3GAT3-203ENST00000532585 1534 ntTSL 1 (best)20.6■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 C1orf61-223ENST00000497822 542 ntTSL 220.5■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 E2F4-208ENST00000567007 2615 ntTSL 220.5■□□□□ 0.879e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SNAPC3-206ENST00000490969 2524 ntTSL 1 (best)20.48■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ADPGK-211ENST00000569058 575 ntTSL 420.4■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 WDR90-208ENST00000547543 1060 ntTSL 520.39■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.39■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RNF207-203ENST00000466994 1854 ntTSL 220.39■□□□□ 0.854e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM11-203ENST00000583264 819 ntTSL 220.38■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PITRM1-211ENST00000490510 778 ntTSL 220.35■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 149.1
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1722.8 ms