RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491889.5

GLIS3-217, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 797 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-217ENST00000491889 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.65■■■■■ 5.54
GLIS3-217ENST00000491889 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.08■■■■■ 4.65
GLIS3-217ENST00000491889 ABCC9O60706 1549 aa42.85■■■■■ 4.45
GLIS3-217ENST00000491889 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
GLIS3-217ENST00000491889 NACADO15069 1562 aa41.34■■■■■ 4.21
GLIS3-217ENST00000491889 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.33■■■■■ 4.21
GLIS3-217ENST00000491889 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.29■■■■■ 4.2
GLIS3-217ENST00000491889 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.17■■■■■ 4.18
GLIS3-217ENST00000491889 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.09■■■■■ 4.17
GLIS3-217ENST00000491889 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.5■■■■■ 4.07
GLIS3-217ENST00000491889 SCRIBQ14160 1630 aa40.23■■■■■ 4.03
GLIS3-217ENST00000491889 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.11■■■■■ 4.01
GLIS3-217ENST00000491889 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.04■■■■■ 4
GLIS3-217ENST00000491889 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.66■■■■□ 3.94
GLIS3-217ENST00000491889 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.08■■■■□ 3.85
GLIS3-217ENST00000491889 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.01■■■■□ 3.84
GLIS3-217ENST00000491889 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.8■■■■□ 3.8
GLIS3-217ENST00000491889 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.66■■■■□ 3.78
GLIS3-217ENST00000491889 SMARCA4P51532 1647 aa38.51■■■■□ 3.76
GLIS3-217ENST00000491889 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.47■■■■□ 3.75
GLIS3-217ENST00000491889 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.28■■■■□ 3.72
GLIS3-217ENST00000491889 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.2■■■■□ 3.71
GLIS3-217ENST00000491889 SMARCA2P51531 1590 aa38.17■■■■□ 3.7
GLIS3-217ENST00000491889 NCAPD3P42695 1498 aa38.12■■■■□ 3.69
GLIS3-217ENST00000491889 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.11■■■■□ 3.69
GLIS3-217ENST00000491889 HMGXB3Q12766 1538 aa37.99■■■■□ 3.67
GLIS3-217ENST00000491889 WIZO95785 1651 aa37.92■■■■□ 3.66
GLIS3-217ENST00000491889 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
GLIS3-217ENST00000491889 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
GLIS3-217ENST00000491889 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.59
GLIS3-217ENST00000491889 NESP48681 1621 aa37.17■■■■□ 3.54
GLIS3-217ENST00000491889 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.11■■■■□ 3.53
GLIS3-217ENST00000491889 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
GLIS3-217ENST00000491889 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.03■■■■□ 3.52
GLIS3-217ENST00000491889 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.01■■■■□ 3.51
GLIS3-217ENST00000491889 ERCC6Q03468 1493 aa36.88■■■■□ 3.5
GLIS3-217ENST00000491889 CFTRP13569 1480 aa36.87■■■■□ 3.49
GLIS3-217ENST00000491889 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.8■■■■□ 3.48
GLIS3-217ENST00000491889 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.78■■■■□ 3.48
GLIS3-217ENST00000491889 PRDM2Q13029 1718 aa36.71■■■■□ 3.47
GLIS3-217ENST00000491889 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.62■■■■□ 3.45
GLIS3-217ENST00000491889 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
GLIS3-217ENST00000491889 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.55■■■■□ 3.44
GLIS3-217ENST00000491889 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.44■■■■□ 3.42
GLIS3-217ENST00000491889 CUX2O14529 1486 aa36.42■■■■□ 3.42
GLIS3-217ENST00000491889 WDR62O43379 1518 aa36.34■■■■□ 3.41
GLIS3-217ENST00000491889 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
GLIS3-217ENST00000491889 TOPBP1Q92547 1522 aa36.08■■■■□ 3.37
GLIS3-217ENST00000491889 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.06■■■■□ 3.36
GLIS3-217ENST00000491889 ABCC8Q09428 1581 aa36.04■■■■□ 3.36
GLIS3-217ENST00000491889 CUX1P39880 1505 aa35.91■■■■□ 3.34
GLIS3-217ENST00000491889 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
GLIS3-217ENST00000491889 IFT140Q96RY7 1462 aa35.75■■■■□ 3.31
GLIS3-217ENST00000491889 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.73■■■■□ 3.31
GLIS3-217ENST00000491889 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.73■■■■□ 3.31
GLIS3-217ENST00000491889 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
GLIS3-217ENST00000491889 SYNJ1O43426 1573 aa35.68■■■■□ 3.3
GLIS3-217ENST00000491889 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.68■■■■□ 3.3
GLIS3-217ENST00000491889 TOP2BQ02880 1626 aa35.66■■■■□ 3.3
GLIS3-217ENST00000491889 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.61■■■■□ 3.29
GLIS3-217ENST00000491889 SOGA1O94964 1423 aa35.6■■■■□ 3.29
GLIS3-217ENST00000491889 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
GLIS3-217ENST00000491889 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.27
GLIS3-217ENST00000491889 WDR97A6NE52 1622 aa35.49■■■■□ 3.27
GLIS3-217ENST00000491889 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.41■■■■□ 3.26
GLIS3-217ENST00000491889 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.39■■■■□ 3.26
GLIS3-217ENST00000491889 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
GLIS3-217ENST00000491889 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.28■■■■□ 3.24
GLIS3-217ENST00000491889 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.21■■■■□ 3.23
GLIS3-217ENST00000491889 PBRM1Q86U86 1689 aa35.21■■■■□ 3.23
GLIS3-217ENST00000491889 GRIN2BQ13224 1484 aa35.17■■■■□ 3.22
GLIS3-217ENST00000491889 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.11■■■■□ 3.21
GLIS3-217ENST00000491889 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
GLIS3-217ENST00000491889 CHD1O14646 1710 aa35.04■■■■□ 3.2
GLIS3-217ENST00000491889 TRIM41Q8WV44 630 aa35■■■■□ 3.19
GLIS3-217ENST00000491889 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.97■■■■□ 3.19
GLIS3-217ENST00000491889 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.97■■■■□ 3.19
GLIS3-217ENST00000491889 KIF27Q86VH2 1401 aa34.95■■■■□ 3.19
GLIS3-217ENST00000491889 ADAMTS12P58397 1594 aa34.91■■■■□ 3.18
GLIS3-217ENST00000491889 SYNJ2O15056 1496 aa34.91■■■■□ 3.18
GLIS3-217ENST00000491889 OSCARQ8IYS5 282 aa34.9■■■■□ 3.18
GLIS3-217ENST00000491889 FBLN2P98095 1184 aa34.88■■■■□ 3.17
GLIS3-217ENST00000491889 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
GLIS3-217ENST00000491889 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.81■■■■□ 3.16
GLIS3-217ENST00000491889 IGF1RP08069 1367 aa34.77■■■■□ 3.16
GLIS3-217ENST00000491889 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.76■■■■□ 3.16
GLIS3-217ENST00000491889 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.76■■■■□ 3.15
GLIS3-217ENST00000491889 GRIN2AQ12879 1464 aa34.74■■■■□ 3.15
GLIS3-217ENST00000491889 CUL7Q14999 1698 aa34.73■■■■□ 3.15
GLIS3-217ENST00000491889 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.63■■■■□ 3.13
GLIS3-217ENST00000491889 CEP170Q5SW79 1584 aa34.58■■■■□ 3.13
GLIS3-217ENST00000491889 NUP160Q12769 1436 aa34.57■■■■□ 3.13
GLIS3-217ENST00000491889 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.57■■■■□ 3.12
GLIS3-217ENST00000491889 EEA1Q15075 1411 aa34.44■■■■□ 3.1
GLIS3-217ENST00000491889 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.41■■■■□ 3.1
GLIS3-217ENST00000491889 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.41■■■■□ 3.1
GLIS3-217ENST00000491889 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.41■■■■□ 3.1
GLIS3-217ENST00000491889 ARHGEF11O15085 1522 aa34.41■■■■□ 3.1
GLIS3-217ENST00000491889 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.41■■■■□ 3.1
GLIS3-217ENST00000491889 PRXQ9BXM0 1461 aa34.36■■■■□ 3.09
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