Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4BQ9NPR2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEMA4BQ9NPR2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms