Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms