Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
YTHDF1Q9BYJ9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms