Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RHOXF2Q9BQY4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RHOXF2Q9BQY4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms