Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TEFMQ96QE5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms