Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q80

DERL3, Derlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DERL3Q96Q80 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DERL3Q96Q80 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms