Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNBD2Q96M20 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms