Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGCZQ96LD1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCZQ96LD1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms